山水林田湖草作為一個生命共同體，是相互依存、相互影響的大系統。自然修復為主的理念，不僅要體現在政府施政方針中，更需落實到具體工作中。在實踐中，要加強對生態修復工程方案的指導和必要的審查，在生態修復工程立項審批環節中，應更加重視對生物多樣性因素的充分考慮和評估，通過生態修復形成順應自然的良性循環。
2020年7月，自然資源部、財政部、生態環境部聯合印發《山水林田湖草生態保護修復工程指南》(試行)。主要內容包括正文和附錄兩部分，正文包括8方面內容:適用范圍、定義、總則、實施范圍和期限、工程建設內容及保護修復要求、技術要求，監測評估和適應性管理，工程管理要求，附錄包括術語、目標分解表和生態監測推薦指標等3方面內容。